Interoperabilitatea este capacitatea diferitelor sisteme, organizații sau țări de a face schimb de informații și de a le folosi în mod semnificativ. Pentru aceasta, participanții trebuie să interpreteze corect informațiile partajate, ceea ce înseamnă utilizarea acelorași standarde și procese pentru un serviciu de e-Sănătate.

Interoperabilitatea este critică în sectorul sănătății, deoarece acest domeniu este eterogen și complex, acoperind diverși actori, de la furnizori la pacienți, care pot fi înregistrați și pot vizita mai multe instituții de îngrijire a sănătății. În plus, sistemele de sănătate constau adesea dintr-o combinație unică de servicii publice și private slab integrate.

Un furnizor de asistență medicală poate oferi doar un anumit tip de serviciu și, astfel, să se ocupe de un subset de pacienți și de informațiile acestora. Acest lucru necesită o interoperabilitate bine dezvoltată între instituții, astfel încât o imagine de ansamblu a unui pacient să poată fi împărtășită.

Colaborarea internațională în domeniul sănătății între statele membre ale UE este adesea împiedicată de diferențele în vocabularul de e-Sănătate utilizat. Acest lucru are ca rezultat interpretări diferite ale acelorași noțiuni și împiedică colaborarea transfrontalieră eficientă. Lipsa interoperabilității se traduce prin diverse probleme cu care se confruntă cetățenii în timp ce încearcă să acceseze serviciile de sănătate în diferite instituții și țări. O interoperabilitate îmbunătățită poate îmbunătăți în mod eficient continuitatea și calitatea serviciilor de asistență medicală din țările partenere din est, rezultând într-o populație mai fericită și mai sănătoasă.