Совместимость – это способность различных систем, организаций или стран обмениваться информацией и использовать ее в своих целях. Для этого участники должны правильно толковать полученную информацию, что подразумевает использование общих стандартов и процессов для оказания услуг электронного здравоохранения.

Совместимость имеет решающее значение в сфере медицины, так как эта область неоднородна, сложна и включает различных деятелей, от поставщиков услуг до пациентов, которые могут посещать несколько медицинских учреждений.  Более того, системы здравоохранения часто представляют собой уникальное сочетание мало связанных между собой частных и государственных услуг.

Медицинское учреждение может предлагать особый вид услуг и, следовательно, иметь дело со специфической подгруппой пациентов и их информацией. Необходима хорошо развитая совместимость между учреждениями, чтобы можно было получить информацию об общем состоянии здоровья пациента.

Международному сотрудничеству в сфере медицины между государствами-членами ЕС часто препятствуют различия в используемой в сфере электронного здравоохранения лексике. Это ведет к различиям в толковании одних и тех же понятий и препятствует эффективному трансграничному сотрудничеству. Недостаточная совместимость приводит к множеству проблем, с которыми сталкиваются граждане при попытке получить доступ к медицинским услугам в различных учреждениях и странах. Повышение уровня совместимости может способствовать непрерывности и повышению качества медицинских услуг в Восточных странах-партнерах, что приведет к росту удовлетворенности и улучшению здоровья населения.